مادگاسکار داستان حیواناتی است که در باغ وحش شهر نیویورک زندگی میکنند که 4تا دوست هستند شیر،گوره خر،زرافه و یک کرگدن ،با گم شدنیکی از آنها بقیه به دنبال او اسیر شده وداخل قفس به آفریقا باز گردانده می شوند و در همین حین یک اتفاق در دریا آنهارابه سمت سواحل ماداگاسکار میکشاند.که با ورود به دنیای وحش با یک بومی ماداگاسکاری که نوعی میمون است آشنا می شوند که سر انجام قهرمان داستان ما با واقعیتهای مقدر شده طبیعت مواجه میشود.